PhDr. Ľudmila Michalková, PhD. vyštudovala hudobnú vedu na Filozofickej fakulte UK v Bratislave. Počas doktorandského štúdia na Umenovednom ústave SAV získala na FFUK akademický titul PhDr. a po jeho skončení vedeckú hodnosť PhD.
Pôsobila ako vedecká pracovníčka na Umenovednom ústave (od roku 1992 na Ústave hudobnej vedy) SAV. Vo funkcii vedeckej tajomníčky podpredsedu SAV sa podieľala na príprave a organizácii viacerých medzinárodných vedeckých sympózií.
Absolvovala študijné pobyty na Hochschule für Musik v Mníchove a Paul Sacher Stiftung v Bazileji.
Ako autorka a moderátorka niekoľko rokov pravidelne spolupracovala s Experimentálnym štúdiom Československého rozhlasu a s Československou televíziou (napr. na tvorbe cyklu Televízny hudobný slovník, Spoznávame slovenskú hudbu, na cykle verejných nahrávok koncertov Koncertné pódium i viacerých samostatných dokumentov).
Od roku 2000 pedagogicky pôsobí na Katedre teórie hudby HTF VŠMU v Bratislave. Jej profilovými predmetmi sú dejiny hudby 18. a 19. storočia a tiež estetika a dejiny estetiky hudby. Špecializuje sa na výskum dejín hudby na Slovensku 18. – 20. storočia nazerané v kontexte dejín európskej hudby a na výskum evanjelickej cirkevnej piesne a liturgie v prameňoch slovenskej proveniencie. K problematike publikovala desiatky odborných štúdií a článkov.
Participovala na spolupráci HTF VŠMU s viedenskou Akademie für Musik und darstellende Kunst.
Pri príprave a realizácii viacerých vedecko-popularizačných projektov spolupracovala s Poľským inštitútom v Bratislave, Hudobným múzeom SNM v Bratislave i Vlastivedným múzeom v Trnave.
